Cell：领域内最权威专家撰写的新冠病毒发端综述发表

2021年5年末，美国总理约翰逊强行：对新可称病毒感染起源地进行为其90天的事件调查。8年末下旬是报告最后时限。

尽管很多人在焦虑地回头事件调查结果，不过CNN报告了消息灵通人士的感叹明：

"nothing too earth shattering，"

（并未什么惊天动地的事情）

而另外面对面，现代科学家从学术比对的角度看，亦不曾作罢理清新可称病毒感染的起源地。

2021年8年末19日，Cell杂志上线了Andrew Rambaut，Kristian Andersen和Edward Holmes等人关于SARS-CoV-2起源地的流行病学，引起了大量转发和热议。

从鼠疫开始，关于病毒感染起源地的分子生物学比对和流行病学很多都来自于这三个比对组，因此他们也是我引用和评论最多的病毒感染起源地比对专家学者。

Holmes和复旦大学共同，在鼠疫开始后第一时间在virological.org完整版了第一个SARS-CoV-2氨基酸，已是了目同一时间所有诊断试剂包疫苗开发的许多现代氨基酸；其上次发表文章的Cell流行病学是病毒感染起源地的一篇佳作。

Andersen上次在virological.org和Nature Med的讨期刊章所述了病毒感染起源地比对的侧向，已是了被引用最多的之外期刊。

因此，这篇近期流行病学可以感叹来自于这个领域最权威的专家学者根据近期信息的重要阐释。

之同一时间我在推特上比对病毒感染氨基酸和解读很多可称状病毒感染串连种传播者单单于兴趣，而现在这些内容可变成了我的岗位总括可。我目同一时间开发COVID-19疫苗能够比对大量红眼可称状病毒感染的氨基酸和Western Blot结果，并借助于表现形式和假病毒感染，解读中的和结果；因为这一从兴趣到岗位内容可的转变，让我对红眼可称状病毒感染串连种传播者有了很多一新专业接触。而这篇近期流行病学结合了WHO报告，从近期的现代科学数据角度看指单单了目同一时间食肉动物串连种传播者是SARS-CoV-2的最或许来源。

虽然2013年在时限镇见到的RaTG13是目同一时间已知与SARS-CoV-2基因氨基酸最相比之下的可称状病毒感染，但现在学术界的共识是RaTG13不是SARS-CoV-2的氏族，而不够或许是两个不同进化分枝上的分立病毒感染；从ORF1ab等氨基酸判断，另外三种在丽江见到的红眼可称状RmYN02，RpYN06和PrC31的潜在基因重组病毒感染（未曾被见到）或许与SARS-CoV-2的氏族不够为相比之下，这些比对来自于中的国学者和Holmes。

我经常感叹，可称状病毒感染串连种传播者十分长时间，但是过渡到大风靡却投票率更高。然而可惜的是，SARS-CoV-2的红眼体内或正中的间食肉动物体内迄今为止仍未被见到，原先的串连物种传播者重大事件也未被见到，这或许是因为未曾对正确的食肉动物物种或种群进行均值，或者SARS-CoV-2的始祖病毒感染正处于低风靡状态。

事实上，很多人类文明病原体（仅限于埃博拉病毒感染、丙型肝炎病毒感染、脊髓灰质炎病毒感染以及可称状病毒感染HCoV-HKU1和HCoV-NL63）的食肉动物起源地未曾确定， 而学者通过十几年的人口稠密比对才见到了与SARS-CoV不具备多达95%的相似性并且应用于人ACE2作为受体的红眼可称状病毒感染，从而锁定了其或许的红眼起源地。

关于Lab Leak Theory，历史上世界lab leak（研究室获知）病原体的重大事件这不罕见，但不曾有lab leak引起大风靡的可能。这是因为lab leak相对于自然起源地不够容易见到和控制。这篇流行病学文章从现代科学迹象上，竭力对此了Shi组或许单单现研究室获知的可能。

文章全面细致地检索了众所周知的现代科学迹象：WIV发表文章的所有bat-CoV比对期刊，指单单WIV和Shi组只成功分离和培育单单3种红眼可称状病毒感染，WIV1-CoV，WIV16-CoV和Rs4874（Ge et al.， 2013；Hu et al.， 2017；Yang et al.， 2015），这三种病毒感染与SARS-CoV不够为相比之下，与SARS-CoV-2相距较远。但是RaTG13不曾被成功分离和培育。WIV也不曾分离或者借助于不具备值得注意的Furin氨基酸的红眼可称状病毒感染。

本来，Furin氨基酸也见诸其他可称状病毒感染如MERS-CoV，HCoV-OC43和HCoV-HKU1；而SARS-CoV-2应用于的RRAR氨基酸是极为低效的蛋白酶切削方式为。目同一时间仅有的在SARS-CoV中的加入Furin氨基酸这不来自WIV（Belouzard et al.， 2009；Follis et al.， 2006）。

另外，被坚称人工掺入的CGG多肽链也见诸SARS-CoV。

远不如疑虑的Gain-of-Function在鼠疫同一时间这不是一个不具备疑虑的病毒感染学比对，国际上病毒感染学界之外比对很多。WIV应用于过SARS-CoV和WIV1-CoV网状作为表现形式，但与SARS-CoV-2相距甚远。

WIV不够未开展过反向基因技术借助于已逝可称状病毒感染。

因此，并未任何现代科学迹象指向研究室获知。

同时，SARS-CoV-2不是红眼可称状病毒感染通过体外传代方法和食肉动物接种适合于方法建立的。SARS-CoV-2许多现代HIV无法感染大鼠，可以感染大量食肉动物的N501Y突变株是在凡人为广泛风靡中的过渡到的。

这一点实际被病毒感染风靡过程反复验证。

SARS-CoV-2提高病毒感染适合于能力从而增加与ACE2结合技能，增加传播者技能和免疫系统逃逸的决定性突变（D614G，N501Y，K417N/T，L452R和E484K/Q）全部是在凡人大风靡后解决问题的，而不是“研究室内刻意挑选的”。这一病毒感染在凡人风靡从而增加适合于能力的过程，提示病毒感染早期风靡时的氨基酸和表型这不是病毒感染最佳的适合于能力状态。

我虽然常感叹可称状病毒感染串连种风靡长时间，但目同一时间似乎，其引发凡人大风靡的频率无论如何也在加快。

这篇不具备权威性质流行病学的试图，其实也是我反复强调的，就是寻找到病毒感染自然起源地的食肉动物体内和串连种传播者都能对预防今后的可称状病毒感染串连种风靡至关重要。

许多现代单单处：

Edward C. Holmes， et al. The Origins of SARS-CoV-2： A Critical Review.Cell， 2021. DOI：https：//doi.org/10.1016/j.cell.2021.08.017.