Nature:复合蛋白释放因子Wapl促进V基因重排的机制

2021-11-22 04:57:33 来源:
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巨噬细胞内内的一些生物学步骤,比如V(D)J苯基,一般来说是由染色体贴图官能团所依赖性,包括染色体区室(compartments)、上同调就其结构设计域(topologically associated domains, 全名TADs)和细胞内一个环(chromatin loop)等。TADs是由细胞内一个环做成(chromatin-loop extrusion)所呈现出的,而这一步骤比如说圆一个环椭圆形的牙龈肽多肽(cohesion complex)。与之相对应的是,牙龈肽特赦突变Wapl可以受限细胞内一个环的延伸(loop extension),从而起到负向依赖性的作用。

一系列突变的转化成,构成了体液免疫抵御外来病原体的主要成分,而突变的多样性,是由V(D)J苯基所做到的,这一步骤,比如说Pax5所抑制的2.8Mb窄免疫球肽重链(immunoglobulin hey chain,全名lgh)底物的挤压。然而在当年体B巨噬细胞(pre-B cells)中所,Pax5是如何依赖性lgh挤压的,仍旧不得而知。

近日,来自罗马尼亚Vienna Biocenter的Meinrad Busslinger研究组在Nature上刊载月出版Wapl repression by Pax5 promotes V gene recombination by Igh loop extrusion的短文,阐明Pax5通过减缓Wapl,从而做到对lgh的依赖性。

因为细胞内一个环做成比如说黏性连肽多肽,所以,所作首先研究在当年体B巨噬细胞中所,牙龈肽多肽各组分的暗示究竟发生变化。所作挖掘出,在RNA高度上,相较于其他大类的免疫巨噬细胞,当年体B巨噬细胞和原B巨噬细胞(pro-B cell)的的Wapl高度持续上升了四倍。肽质高度也有类似的挖掘出。这些结果暗示,黏性连肽特赦突变Wapl的持续上升,很确实增高黏性连肽在细胞内上的存留时间。

有报道宣称,Pax5可以依赖性lgh底物挤压,所作接下来探讨,Pax5究竟可以阻碍Wapl在当年体B巨噬细胞中所的暗示。所作通过Pax5等位基因缺陷激素挖掘出,其会了Pax5的当年体B巨噬细胞,Wapl的mRNA高度增高了4~6倍。另外,当年体B巨噬细胞中所,Wapl上存在2个Pax5联结底物P1和P2,而在未成熟的B巨噬细胞中所,联结底物增高至1个(仅存P2)。这些结果暗示,在当年体B巨噬细胞中所,Pax5可以减缓Wapl高度。

在P1敲除激素中所,甲状腺中所的B巨噬细胞愈合大体停留在当年体B巨噬细胞阶段,这暗示,B巨噬细胞愈合是受Wapl上Pax5联结底物P1所依赖性的。另外,通过VDJ脱氧核糖核酸,所作挖掘出,P1敲除的激素,当年体B巨噬细胞中所VDJH的苯基比重显着增高。而在Pax5敲除激素中所,也同样挖掘出类似的现象,并且,Pax5激素lgh底物无法进行挤压。这些结果暗示,Wapl上的Pax5联结底物P1可以其会lgh细胞内一个环做成。

最终,所作关注Pax5对Wapl的减缓,究竟会阻碍当年体B巨噬细胞整个染色体的结构设计。所作挖掘出,只有在B巨噬细胞愈合的更早阶段,Pax5可以阻碍黏性连肽在细胞内上的驻留时间。并且,与正常的当年体B巨噬细胞相比,Pax5敲除激素的当年体巨噬细胞和P1,P2敲除的当年B巨噬细胞,其TADs中所细胞内一个环的呈现出高度显着增高;与此相对的是,大片段的细胞内挤压,从而呈现出染色体间隔的高度,却大大升高。这些结果暗示,在原B巨噬细胞中所,Pax5的联结底物P1所其会的Wapl高度增高,明显阻碍了整个巨噬细胞的染色体结构设计。

综上所述,所作挖掘出,在当年体B巨噬细胞和原B巨噬细胞中所,Pax5可以减缓黏性连肽特赦突变Wapl的暗示,从而延窄黏性连肽在细胞内上的驻留时间,进而促进细胞内一个环做成高度的升高。这一步骤是通过Wapl上的Pax5联结底物P1做到的。而且,Wapl暗示高度的增高,可以招致染色体结构设计的适度变化,这也是当年体B巨噬细胞中所发生高高度的V等位基因苯基的确实原因之一。

值得一提的是,就在这篇Nature截止后的次日,先于印行bioRxiv上在线发布新闻了来自哈佛Frederich AltLaboratory月出版“Loop Extrusion Mediates Physiological Locus Contraction for V(D)J Recombination”的类似工作,同样归功于Wapl通过阻碍细胞内一个环做成阻碍等位基因苯基的重要作用。

原始出处:

Louisa Hill 1, Anja Ebert 1, Markus Jaritz 1, et al.Wapl repression by Pax5 promotes V gene recombination by Igh loop extrusion.Nature. 2020 Jul 1. doi: 10.1038/s41586-020-2454-y.

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