Lancet Oncol:肾透明细胞癌与肥胖论题相关的转录组特征分析

2021-11-15 05:29:55 来源:
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一.研究课题背景

成年人与膀胱半透明细胞胰脏 (ccRCC)的不确定性增加有关,但成年人又矛盾地与该的病病征改善有关,其潜在系统尚能不确切。现笔记对成年人病变和也就是说腰围病变在原发和结节周油脂小组织之前的腹腔填充和病原体转录小组关联来进行研究课题数据库分析。

本文介绍了转录招致的微环境的关联有助于断言成年人病变的生存环境优势(成年人猜想)。

二.数据库分析方式上三.短文讲解1.COMPARZ表头、TCGA-KIRC表头、MSK病原体治疗法表头数据库收集、外科

在COMPARZ表头的453名病变之前,有375名(83%)病变带有能用的微阵列数据库,治疗法前BMI测量以及无进展和总纤生存环境数据库来进行数据库分析(列于1)。除119名(26%)增重病变外,来自COMPARZ试验性的就此表头除此以外256名(68%)病变(n=256)。

列于1.COMPARZ临床试验性表头的人均收入博弈论和临床相似性

TCGA-KIRC表头之前的332唯病变之前,评估了经膀胱切除奥义治疗法的152唯(46%)更早(即AJCC III和IV期)ccRCC病变的临床和人均收入博弈论数据库(列于2)。在剔除59名(39%)增重病变后,之后获得的表头除此以外93名病变(n=93)。

列于2.更早半透明细胞膀胱细胞胰脏TCGA-KIRC表头的人均收入学和临床相似性

从62唯MSK区域内油脂小组织表头之前来进行膀胱脏切除奥义的非冠心病半透明细胞RCC病变之前获得了原发性和区域内油脂样品。在这个表头之前,从59名病变的PNN(膀胱周郊外)区域内油脂,25名病变的PNA(远处膀胱周)区域内油脂以及55名病变的小组织之前抽样。在剔除增重病变此后,就此表头除此以外41名(69%)PNN抽样病变, PNA抽样为17(68%),抽样为37(67%)。从最初的203名参加者的MSK病原体治疗法研究课题人一小组之前剔除74名(36%)增重病变后,总生存环境数据库分析的就此表头除此以外129名(64%)参加者(列于3)(n=129)。

列于3. 采用MSK病原体治疗法的临床试验性表头的人均收入博弈论和临床相似性

2.成年人的膀胱半透明细胞胰脏病变一般而言也就是说腰围的膀胱半透明细胞胰脏病变总生存环境期更长

根据KM生存环境数据库分析,在三小组之前都推测成年人病变的总生存环境期更长。在TCGA-KIRC表头之前,经分期修正后,成年人病变的总纤存活期常为也就是说腰围小组;在COMPARZ表头之前,经IMDC不确定性低分修正后,胖病变的总纤存活期也常为也就是说腰围小组。在MSK病原体疗法表头之前,经IMDC不确定性低分修正后,BMI与死亡率的无总纤关联(如布1)。

布1.TCGA-KIRC表头 (A)、COMPARZ 表头(B)和MSK病原体治疗法表头(C)的总生存环境期

3.COMPARZ表头之前成年人病变带有更容易的PFS

对CPMPARZ表头KM数据库分析后,KM曲线说明了,COMPARZ表头之前成年人病变比也就是说腰围病变带有更容易的PFS。

布S1.COMPARZ表头之前成年人病变比也就是说腰围病变带有更容易的PFS

4.用于二线制剂治疗法,成年人病变仍带有更容易的OS

KM曲线说明了了在用于二线乙酰还原酶抑制剂(pazopanib或Sunitinib)的两个治疗法小组之前,成年人病变的OS即便如此较也就是说腰围病变好。

布S2.COMPARZ表头用于二线制剂治疗法小组的总生存环境期数据库分析

5.COMPARZ表头之前,成年人与也就是说腰围的病变转录小组突变相似性普遍存在总纤关联

做完上述数据库分析,笔记在三个表头之前断定成年人猜想普遍存在此后,每一次在COMPARZ表头之前对成年人和也就是说腰围病变评估了转录小组学关联。先是做了Hallmark突变集的GSEA数据库分析,非常成年人病变与也就是说腰围病变中时有的关联:成年人病变之前说明了诱发、TGF-β、上皮-时有充质彻底改变和腹腔填充瞬时通路总纤上调,若有皮肤上软骨途径的乙酰(布A)。布B是对布A筛选的几个转录通路的Enrichment plots。

布S4.COMPARZ表头之前成年人病变与也就是说腰围病变的ccRCC转录小组突变相似性普遍存在总纤关联

6.COMPARZ表头与TCGA-KIRC表头 之前成年人比也就是说腰围病变的腹腔填充低分很高

在GESA派生的相似性突变集腹腔填充低分非常之前,成年人病变很高于也就是说腰围病变(如布2)。

布2.COMPARZ表头(A)与TCGA-KIRC表头 (B)之前成年人原发病变与也就是说腰围病变的腹腔填充的z score

7.也就是说腰围与成年人病变的淋巴细胞一小组无总纤关联

对也就是说腰围(7唯)与成年人(16唯)病变的原发的主要淋巴细胞量均采用流式细胞奥义来进行评估。布A说明了了成年人病变与也就是说病变中时有的淋巴细胞一小组的总纤关联。布B确切说明了了成年人和也就是说腰围病变T细胞一小组的浸润水平。推测也就是说腰围与成年人病变的淋巴细胞一小组无相比较关联,淋巴细胞浸润的程度与BMI无关。

布S9.用流式细胞奥义数据库分析也就是说腰围与成年人病变的淋巴细胞一小组无相比较关联

8.与也就是说腰围病变相比较,成年人病变结节周油脂小组织炎病征增加,众所周知是郊外的结节周油脂

在MSK的非冠心病ccRCC病变的前瞻性表头之前,笔记改组了20个最总纤的丰富的IPA原则通路,这些通路来自于成年人和也就是说腰围病变的PNN和PNA抽样的非常(布A)。成年人和也就是说腰围病变的PNN和PNA抽样中时有的病原体浸润(ssGSEA低分)非常(布B)。

布S5.与也就是说腰围的病变相比较,成年人病变的膀胱周油脂说明了出炎病征和诱发增加

综上,在COMPARZ试验性表头之前,经过IMDC不确定性低分微调后,推测一般而言也就是说腰围病变,乙酰还原酶抑制剂治疗法必要性提很高了成年人病变的生存环境率,之外是遵从sunitinib治疗法的病变。IMDC不确定性低分模型相关联的小反应物时有接反映病原体因素对胰脏病征全面性炎病征作用(唯如糖尿病,之前性白血球增多,和血小板增多病征),这些因素可能也是病原体治疗法结果和BMI中时有关联系统的状况。推测成年人病变的腹腔填充分数很高于也就是说腰围病变,与之前其他的研究课题结果列于明的,参加腹腔填充,β-氧化途径等等突变的钼的物理现象一致。因此,腹腔填充的关联可以部份断言成年人病变遵从乙酰还原酶抑制剂治疗法后的较好病病征。

此研究课题为成年人猜想包括了生物化学支持。在患有ccRCC的病变捕捉到到成年人病变一般而言也就是说腰围的病变微环境的关联:之外是成年人病变的的腹腔填充增加,但总纤炎病征无相比较关联。在在的是成年人病变的区域内油脂说明了增加的炎病征和诱发状况。半透明细胞胰脏与结节周油脂小组织微环境的比较简单相互作用可能带有临床意义,没人必要性研究课题。

原始出处:

Sanchez A, Furberg H, Kuo F, Vuong L, Ged Y, Patil S, Ostrovnaya I, Petruzella S, Reising A, Patel P, Mano R, Coleman J, Russo P, Liu CH, Dannenberg AJ, Chan TA, Motzer R, Voss MH, Hakimi AA. Transcriptomic signatures related to the obesity paradox in patients with clear cell renal cell carcinoma: a cohort study.Lancet Oncol. 2020 Feb;21(2):283-293

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